به کار گیری روش High Resolution Melting در شناسایی چند شکلی‌های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن STK11 در مبتلایان به انواع سرطانهای دستگاه گوارش
نویسندگان
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: آنالیز HRM (High Resolution Melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب DNA در اثر خروج رنگ اندازه‌گیری می‌نماید. ژن STK11 یکی از پروتئین‌های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می‌نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و همچنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می‌نماید. موتاسیون‌های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم Peutz-Jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازی‌ها می‌باشند.روش بررسی: در این مطالعه تجربی، DNA ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطانهای دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR و High(HRM) resolution melting بررسی نمودیم. یافته‌ها: غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک HRM دو نوع SNP در اینترون‌های 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی C/T [cluster id/dsSNP/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی C/G [cluster id/dsSNP/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج HRM با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد. نتیجه‌گیری: هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان می‌دهد غربالگری اولیه ژن STK11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش HRM به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء می‌باشد.
منابع مشابه
به کار گیری روش high resolution melting در شناسایی چند شکلی های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن stk۱۱ در مبتلایان به انواع سرطان های دستگاه گوارش
سابقه و هدف: آنالیز hrm (high resolution melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب dna در اثر خروج رنگ اندازه گیری می نماید. ژن stk11 یکی از پروتئین های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و هم چنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می نماید. موتاسیون های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم peutz-jeghers واستعداد اب...
متن کاملبررسی حساسیت و اختصاصیت روش high resolution melting analysis در شناسایی انواع جهش های مختلف ژن rb1
روش های متنوعی برای شناسایی جهش ها ابداع شده است که هریک از آنها دارای مزایا و معایب خاص خود هستند. یکی از روش هایی که اخیراً ابداع شده و در مطالعات مختلف به کارآیی بالای آن اشاره شده است روش high resolution melting analysis یا hrm است. در مطالعه حاضر برای اولین بار در ایران به منظور شناسایی جهش ها تمامی اگزون های ژن rb1 با استفاده از روش تعیین توالی بررسی شده است. در ادامه به منظور بررسی حساسیت...
ارزیابی تومور مارکرTPS به روش الیزا به منظور تشخیص زود هنگام و پی‌گیری درمان سرطانهای دستگاه گوارش
Background: TPS is one of the tumor markers which has specially been considered due to its exclusive physiological characteristics like its easy measurement in serum of cancer patients. This study has been due to evaluate the efficiency of this tumor marker in the prognosis, treatment control and follow up of patients with gastrointestinal cancers including esophagus, stomach and colorectal. M...
متن کاملسه موتاسیون ژرم لاین جدید در ژن MLH1 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال ارثی
Abstract Background: Hereditary non-polyposis colorectal cancer is the most common cause of early onset of hereditary colorectal cancer. In the majority of Hereditary non-polyposis colorectal cancer families, microsatellite instability and germline mutation in one of the DNA mismatch repair genes in clouding MSH2, MLH1, MSH6 and PMS2 are found. The Objective of this study was to determine th...
متن کاملبررسی اپیدمیولوژیک سرطانهای بخش فوقانی دستگاه گوارش در بیماران مراجعه کننده به بیمارستان شهدای عشایر خرم آباد
Background: With advances in medical sciences and control of infectious diseases cancers in human societies are increasingly attract attention Cancers of upper gastrointestinal is among the most important cancers which has a high incidence in many countries. Materials and Methods: This cross-sectinal study was conducted on 73 patients with dysphagia, epigastric pain, and weight loss in the sho...
متن کاملگزارش یک موتاسیون ژرم لاین جدید در ژن PMS2 در بیمار مبتلا به سرطان ارثی روده بزرگ
چکیده زمینه و هدف: سرطان ارثی کلون و رکتوم (HNPCC) یک سندرم اتوزومال غالب است. معمولا در این سندروم پیشرفت سرطان در سنین جوانی افراد، اغلب 40 تا 50 سالگی، خود را نشان می دهد. موتاسیون در ژن‌های مسوول ترمیم ژنوم می‌تواند سبب این بیماری شود. یکی از ژن‌های درگیر در این بیماری ژن PMS2 می باشد. در این مقاله، بیماری معرفی می‌شود که موتاسیون ژرم لاین جدیدی در ژن PMS2 دارا می باشد. هدف از این مطالعه ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 21 شماره 4
صفحات 233- 237
تاریخ انتشار 2012-02
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023